Afin de comprendre comment la nourriture peut avoir un impact sur le microbiote, il faut d’abord s’intéresser au fonctionnement de l’intestin et l’absorption des aliments au sein de celui-ci.

Au sein notre petit intestin, sur la paroi de celui-ci, il y a des villosités, en forme de « cloche ». Ces cloches sont tapissées de cellules, qu’on appelle des entérocytes. Ces cellules sont responsable de l’absorption des aliments et de la transmission des nutriments dans le sang.